转录组测序

    转录组测序 :

转录组广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的集合，包括信使RNA（mRNA）、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA；狭义上指所有mRNA的集合。蛋白质是行使细胞功能的主要承担者，蛋白质组是细胞功能和状态的最直接描述，转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的必然纽带，是研究基因表达的主要手段。转录组研究是基因功能及结构研究的基础和出发点，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。转录水平的调控是目前研究最多的，也是生物体最重要的调控方式。

目前，常见的高通量测序仪都可以用于转录组测序。具体建库与测序技术在针对mRNA、lncRNA和miRNA的检测上会有所不同。在测序深度足够深的情况下，lncRNA可以被普通的RNA-Seq检测到，但miRNA的测序需要不同的样品制备过程。在完成转录组测序后，其结果可以应用于很多方面，包括获得物种或者组织的转录本信息、得到转录本上基因的相关信息，如基因结构、功能等，还可以发现新的基因、对基因结构进行优化、发现可变剪切、发现基因融合、对基因表达差异进行分析，以及结合DNA层面的变异信息、调控层面的数据等分析变异对表达的影响、调控元件对表达的影响等，从而理解其深层次的作用机制。

转录组测序可以在一定程度上替代基因表达芯片，并且可以提供更丰富的信息。在心理学研究方面，转录组测序已经取得了一定的成果。一项对创伤后应激障碍的转录组测序分析表明，包括FKBP5在内的99个基因表达与创伤后应激障碍相关。进一步研究发现，HPA轴与免疫失调是创伤后应激障碍的关键生物学过程。